孔府仿照封建王朝的六部而设六厅，在二门以内两侧，分别为管勾厅、百户厅、典籍厅、司乐厅、知印厅、掌书厅、公共管理孔府事务。

初期的孔庙仅有孔子故宅三间，其后裔在简陋的故宅中奉祀孔子，依庙建宅。随着孔子地位及其子孙官位的升高，孔氏住宅日益扩展。

明正德以前，孔府不在曲阜城内，在县城以外，距城10里。

嘉靖年间，为保卫孔府孔庙，明世宗下令迁移曲阜县城，移城卫庙。

经十年时间建成曲阜新城，城墙高耸，外有很深的护城河，孔府、孔庙居于曲阜城中，奠定了现孔府的规模。

辛亥革命后，孔子嫡裔仍受前代荣典。孔子的七十七代孙孔德成改为“大成至圣先师奉祀官”，给予特任待遇。

孔府正门坐北朝南，迎面是一个粉白的大照壁，门前左右两侧，有一对2米多高的圆雕雌雄石狮。

红边黑漆的大门上镶嵌着狻猊铺首，大门正中上方的高悬着蓝底金字的“圣府”匾额，相传为明相严嵩手书。

孔府中路的第二道大门，俗称二门。

门楣高悬明代诗人、吏部尚书、文渊阁大学士李东阳手书“圣人之门”竖匾，下有阀阅承托，门柱有石鼓夹抱。

正门左右各有腋门一座，耳房一间。在封建社会，平时只走腋门，正门不开，以示庄严。

屏门为木构，四周不与垣墙连属，独立院中，类似遮堂门。屏门顶覆灰瓦。门楣因悬明世宗亲颁“恩赐重光”匾额，故称“重光门”。

重光门平时是不开的，每逢孔府大典、皇帝临幸、宣读诏旨和举行重大祭孔礼仪时，才鸣礼炮开启。

重光门因独立院中，把前院和后院隔绝开来，所以又叫“塞门”。据说这样的塞门一般官司宦人家是无资格建立的，只有封爵的“邦君”才能享受此荣。

孔府大堂是衍圣公宣读圣旨接见官员、申饬家法族规、审理重大案件，以及节日、寿辰举行仪式的地方。

大堂中央有一绘流云、八宝暖阁，正中的太师椅上，披铺一张斑瓓虎皮，椅前狭长高大的红漆公案上，摆着文房四宝、印盒、签筒。

……

“衍圣公，不好啦，朝廷大批军警包围了咱孔府。护卫拦不住，他们已经冲进来啦......”

“什么，胆大妄为，胆敢冲击孔府！”衍圣公孔胤植坐在孔府大堂的太师椅上，一脸震惊。

虽然想到过会被小皇帝问罪，可小皇帝采用这个阵势对付孔府，还是让孔胤植没有想到，真是有辱斯文，有辱斯文呐。

“孔胤植何在？”一名执行抓捕任务的军官冲进孔府大堂大声喝问道。

“老夫便是孔圣人第六十五世孙，衍圣公孔胤植。”

“哈哈，大言不惭，谁封你做衍圣公的？自封的吧？”军官嘲笑道。

“啊？哦？”孔胤植一下子被怼住了，自己这衍圣公还真没有得到朝廷的正式敕封。小皇帝一直推托，迟迟不下旨敕封，难道早就要搞我了？

“孔胤植，你的事犯啦，跟我们走吧。不要做无谓的反抗，免得辱没了孔夫子的名声。”